Acessamos um conjunto de dados de genótipos 50K Illumina SNP de duas importantes raças caprinas do semiárido brasileiro para analisar a abundância e duração de corridas de homozigosidade (ROH). Esta análise visa elucidar a importância da história de adaptação no genoma das populações caprinas brasileiras e mensurar a endogamia genômica. Regiões ricas em heterozigosidade (HRR) ou regiões genômicas de alta variabilidade genética fornecem pistas sobre como a diversidade pode estar associada ao aumento da aptidão, evitando alelos homozigotos deletérios. No geral, foram identificadas 22.872 ROH. O número médio de ROH por indivíduo variou de 74,73 (raça comercial Anglo-Nubiana) a 173,85 (raça crioula Marota). A análise da distribuição das corridas de homozigose de acordo com o tamanho mostrou que, para ambas as raças, a maioria dos ROH estava na categoria curta (<2,0 Mb) (65,6%). A endogamia baseada em ROH (FROH) revelou níveis baixos em Anglo-Nubianos (0,0627) e altos níveis em Marota (0,1419), provavelmente devido a uma redução no tamanho efetivo da população ao longo de gerações na raça tradicional Marota. Definimos ilhas de ROH e HRR e identificamos regiões comuns na cabra Marota, onde estão localizados genes a SNP de duas importantes raças caprinas do semiárido brasileiro para analisar a abundância e duração de corridas de homozigosidade (ROH). Esta análise visa elucidar a importância da história de adaptação no genoma das populações caprinas brasileiras e mensurar a endogamia genômica. Regiões ricas em heterozigosidade (HRR) ou regiões genômicas de alta variabilidade genética fornecem pistas sobre como a diversidade pode estar associada ao aumento da aptidão, evitando alelos homozigotos deletérios. No geral, foram identificadas 22.872 ROH. O número médio de ROH por indivíduo variou de 74,73 (raça comercial Anglo-Nubiana) a 173,85 (raça crioula Marota). A análise da distribuição das corridas de homozigose de acordo com o tamanho mostrou que, para ambas as raças, a maioria dos ROH estava na categoria curta (<2,0 Mb) (65,6%). A endogamia baseada em ROH (FROH) revelou níveis baixos em Anglo-Nubianos (0,0627) e altos níveis em Marota (0,1419), provavelmente devido a uma redução no tamanho efetivo da população ao longo de gerações na raça tradicional Marota. Definimos ilhas de ROH e HRR e identificamos regiões comuns na cabra Marota, onde estão localizados genes relacionados a diversas características, como desenvolvimento embrionário, crescimento corporal, homeostase lipídica e funções cerebrais. Estes resultados indicam que tais regiões estão associadas a muitas características e, portanto, têm sofrido pressão seletiva nessas raças caprinas criadas diferentes fins. características, como desenvolvimento embrionário, crescimento corporal, homeostase lipídica e funções cerebrais. Estes resultados indicam que tais regiões estão associadas a muitas características e, portanto, têm sofrido pressão seletiva nessas raças caprinas criadas para diferentes fins.